Descobri:
Ao usar os módulos e temas padrão do drapal Synaptic, clique aqui: /usr/share/drupal6/sites
. Faça o diretório all/modules
e solte em seus módulos.
Como um fyi, para encontrar os arquivos instalados usando o Synaptic ou a linha de comando, use os seguintes comandos:
$ sudo updatedb
$ locate drupal6
(Altere drupal6
para o que você está procurando).