Você não pode alterar livremente o diálogo;
É uma janela GUI normal do programa gksudo .
Mas, dependendo das suas necessidades, pode ser bom o suficiente personalizar o tema gtk para essa janela.
Isso não permitiria alterar a forma da janela, mas suporta várias alterações no espaçamento, fontes, cores e tamanhos dos elementos da interface do usuário (pode não ser fácil de fazer).
Você pode encontrar uma alternativa para gksudo para substituí-lo.