Costumo usar o Wine para executar aplicativos que não funcionem de outra forma e simplesmente para testar como eu gosto do projeto. De fato, quando eu "descubro" algo que funciona, eu o adiciono ao Appdb. Então eu usaria várias versões do vinho sem corromper a principal (.wine [versão de desenvolvimento]).
Como posso compilar a versão desejada (baixada de fontes) evitando substituir a principal? Onde é o melhor local para instalar esta versão? (esperando que funcione) Quais parâmetros devo usar para não mexer em nada? Como posso usá-los então? Eu tenho que ir na dir e simplesmente correr vinho? Espero que não esteja compilando erros, mas acho que procurando o README, eu farei:)
Você pode usar o PlayOnLinux para fornecer várias versões do WINE. Existe também algo chamado WINE Bottle Manager, mas eu não tenho um link para isso (e eu não tenho certeza se está nos repositórios). Se eu encontrar mais informações, atualizarei minha resposta.