Parece que o servidor VNC está pressionando a seleção X Window para a área de transferência dos clientes.
A seleção X Window é atualizada sempre que você seleciona texto. No seu caso, isso foi feito selecionando o texto na barra de endereço do seu navegador, o servidor vnc, em seguida, copiou isso na prancheta do seu cliente, que substituiu a área de transferência local. O ato de excluir o texto selecionado não é relevante, portanto, não importa como você excluiu isso.
A solução é desativar a opção "Enviar seleção principal para visualizadores" em vncconfig