No manual do FreeBSD sobre pkgng :
The package database conversion may emit errors as the contents are converted to the new version. Generally, these errors can be safely ignored. However, a list of third-party software that was not successfully converted will be listed after pkg2ng has finished and these applications must be manually reinstalled.
Esses erros estão relacionados a display , mtree , conflicts manipulação de palavras-chave: nada para se preocupar, pois são casos obsoletos ou exóticos. Conforme indicado no documento, o pacote instalado que não conseguiu converter seria listado.
A conclusão aqui é que o novo pkg info fornece todos os pacotes que você tinha.