Primeiro: ionice -c3
significa o agendamento inativo (é isso que você quer), -c2
é para o melhor esforço.
Segundo: você pode usar o controlador cgroups blkio para afinar o agendamento.
Terceiro: não use mais encadeamentos do que seus núcleos físicos. Portanto, se você não tiver 64 núcleos em seu computador, diminua-o. Por exemplo: -j4