Se ainda não o fez, tente instalar matplotlib
através do comando conda
. As bibliotecas para anaconda são mantidas separadas das instaladas para python por pip e tal. Eu arriscaria a adivinhar que a anaconda não pode realmente encontrar a biblioteca. Outra possibilidade pode ser o uso de uma biblioteca incompatível, nesse caso, desinstalar o matplotlib e, em seguida, usar conda
install.