Oi eu preciso para obter a soma de cada coluna em um arquivo, precisa ser flexível para tantas colunas como em qualquer arquivo fornecido
atualmente eu uso:
awk '{for (i=1;i<=NF;i++) sum[i]+=$i;}; END{for (i in sum) print sum[i];}'...
Eu tenho um arquivo delimitado por tabulações, quero extrair entradas "exônicas" da segunda coluna, entradas "não sinonais SNV" da terceira coluna e valores menores que (< 1) e ponto (.) da coluna 4ª, 5ª 7ª
Chr Func.refGene ExonicFu...
Eu tenho um rastreamento de pilha como este:
17/04/26 15:29:03 INFO HttpMethodDirector: Retrying request
17/04/26 15:29:03 ERROR NetworkClient: Node [192.168.5.5:9200] failed (Connection refused (Connection refused)); no other nodes left - ab...
Estou tentando executar um comando que é algo como isto
intersectBed -a yeast.v2.bed -b cov.txt -wa -wb | awk -v OFS="\t" '{print $7,$8,$9,$6,$11,$10}' > out.txt
out.txt parece com isso
chrI 151006 151096 0
chrI 142253 1426...
Eu tenho um arquivo de texto grande (> 200MB). Eu quero ler [n, n + a] bytes em todas as linhas.
Suponha que haja 1000 linhas no arquivo de texto original. O arquivo de saída seria de 1000 linhas.
O que eu sei head -c349 original.text|...
Para os valores abaixo eu tenho que substituir o segundo e quarto "." por "," no arquivo abaixo
entrada
1.351364711.103.7319660.2010-01-01 00:00:00
1.345529841.103.7372875.2010-01-01 00:00:49
1.342955629.103.7455272.2010-01-01 00:01:42
1.3...
Eu tenho usado awk em um script Expect para editar um arquivo de texto que contém informações sobre um switch. Até agora, o arquivo de texto é assim:
Device ID Local Intrfce
BIOTERIO Gig 1/0/6
N7K-LAN(JAF1651ANDL) Gig 1/0/1 134...
Estou usando o parâmetro de cadeia de várias linhas Jenkins para anexar novas entradas a um arquivo yaml. Mas, em seguida, quero formatar essas entradas para corresponder à sintaxe yaml.
O resultado final desejado é:
var:
- subvar1
- s...
Eu tenho uma função que retorna uma versão da primeira linha de um arquivo
checkVersion(){
Version=($(awk -F "|" '{print(substr($7,1,1))}' $1))
echo "spark version $Version"
return $Version
}
e usado no loop if
if [ $(Version in...