Perguntas sobre 'gridengine'

1
resposta

Empilhe a saída da tela em colunas para fazer uso da largura da tela e evite a rolagem

Costumo usar o comando qstat do gridengine em nosso cluster HPC, mas como tenho muitos trabalhos em execução no cluster, a saída é muito longa para caber na tela e acabo fazendo muita rolagem para ver a parte superior seção da saída. Meu term...
22.02.2017 / 17:12
2
respostas

Como posso verificar se um trabalho está em execução no cluster usando o nome do trabalho (CentOS)

Estou executando um script bash para enviar vários trabalhos. A apresentação de um trabalho só acontece se esse trabalho já não estiver em execução. Eu quero usar uma declaração if dentro do meu script bash para simplesmente verificar se "job123...
01.08.2016 / 17:00
1
resposta

Generalizando o arquivo de tarefa qsub do Mecanismo de Grade para vários programas e nomes de arquivos de entrada

Estou usando o Grid Engine em um cluster Linux. Estou executando muitos trabalhos com diferentes programas e diferentes arquivos de entrada. Eu não quero criar vários scripts de tarefas específicas para cada par de programa e arquivo de entrada....
19.01.2017 / 20:11
1
resposta

Como saber o uso de memória de cada trabalho em segundo plano

Estou trabalhando no SGE e estou conectado a ele. Eu uso o qlogin -l mf = 30G para entrar em um nó de computação. Estou executando 2 trabalhos neste nó de computação em segundo plano. [1] 4408 Running /apps1/sratoolkit/2....
24.03.2015 / 17:32
1
resposta

dificuldades de conexão SSH

Estou usando o RED HAT 5.9 OS na minha grade, tendo 3 máquinas: 1 nó principal (conhecido como ilmn-qm.ilmn) e 2 nós computacionais (também conhecido como compute-00-00 e compute-00-01). O problema é que não consigo usar o SSH de nenhuma das...
06.02.2018 / 12:52
1
resposta

Grid engine / cluster management e job scheduler para Debian / ubuntu

Eu preciso executar uma grande quantidade de cálculos em algo parecido com um cluster, o hardware e o sistema operacional são idênticos (o sistema operacional é o Ubuntu), mas nenhum software de gerenciamento central ou mecanismo de grade está i...
15.07.2017 / 11:18
1
resposta

Grid Engine para programa que precisa do X11 mas não requer entrada do usuário

Eu tenho um script bash que chama um executável (algum software comercial) em "modo batch". Na linha de comando, se X estiver disponível, o programa é executado até a conclusão e, em seguida, sai, mas se não o programa trava. Eu acho que isso po...
15.06.2016 / 10:03