Parece que o grub foi instalado no usb. Do seu sistema Ubuntu inicializado, abra um terminal e use os seguintes comandos para instalar o grub na unidade interna:
sudo grub-install /dev/sdX
sudo update-grub
Substituindo sdX
pela unidade real, que provavelmente será sda
, mas use o utilitário de disco para verificar novamente se não tiver certeza.