Como mencionado em comentário , você está executando dois tipos diferentes de kernel nas máquinas:
3.2.0-33-generic para 12.04.1 e 3.2.0-45-virtual para 12.04.2
generic é para hardware de uso geral e o virtual é otimizado para máquinas virtuais. Especificamente na parte de E / S de disco, posso imaginar que um planejador é muito menos relevante, pois não acessará discos brutos, mas sim discos virtuais. O sistema operacional do host terá que reagendá-lo de qualquer maneira quando ele gravar no disco físico.
Resumindo: você não pode comparar esses dois kernels.