xUbuntu : O 'x' significa qualquer versão . Então, neste caso, "xUbuntu" significa "Ubuntu ou Xubuntu ou Kubuntu ou Lubuntu".
Qual deles eu devo escolher? : Na minha opinião, o melhor seria usar o xUbuntu, porque é mais provável que ele tenha as dependências necessárias para o Ubuntu.
Devo perguntar aos desenvolvedores? : não acho que seja necessário, pelas razões já apresentadas.
Então, para instalar a versão 2.5.2 do TeXstudio no Ubuntu 12.04 x86_64 (64bits), você deve fazer isso:
wget http://download.opensuse.org/repositories/home:/jsundermeyer/xUbuntu_12.04/amd64/texstudio_2.5.2_amd64.deb
sudo dpkg -i texstudio_2.5.2_amd64.deb
sudo apt-get install -f
Ou, graficamente, faça o download este pacote e instale-o com o Centro de Software.