Mas com uma nota pessoal:
Usando .deb permite que você acompanhe a instalação. (por exemplo, você pode desinstalar ou atualizar mais tarde). Instalar a partir da fonte (.tar.gz ou outro) coloca você no comando do que e onde instalar. Você pode ter várias versões instaladas em vários locais e elas são difíceis de serem desinstaladas. Pessoalmente eu prefiro arquivos .deb.