O exFAT está suficientemente estável no Ubuntu 14.04?
Bem, ele está em uso de forma bastante ampla e eu mesmo não vi usuários com problemas onde eles estão perdendo dados devido a erros na implementação exfat / fusível.
Com todos os sistemas de arquivos que não são nativos do Linux: tenha cuidado ao usá-los e sempre mantenha uma cópia do Windows em seu sistema (mesmo quando não estiver usando: é mais seguro reduzir o sistema Windows a um mínimo e editar o grub config para pular perguntando qual sistema operacional iniciar, então removê-lo completamente. Haverá um momento em que a partição será desmontável do Linux e você precisará de uma ferramenta do Windows para consertá-lo).
Apenas por um motivo, eu ficaria com o NTFS: o exfat é disponível apenas como um arquivo pessoal e o ntfs é nos repositórios. Então parece que a Canonical não considera bom o suficiente para incluir nos repositórios ainda (no entanto, uma vez que é incluído no Debian, então eu esperaria que ele fosse incluído também em 14.10)