Perguntas sobre 'portable-batch-system'

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Como posso obter o modo shell-script no Emacs para interpretar #PBS -S / bin / bash como um código shell bash?

Estou usando o Emacs em um sistema Linux que usa o Portable Batch System (PBS) para controlar o uso de recursos. Os scripts PBS exigem "#PBS -S / bin / ..." como a primeira linha no script para declarar o shell do script para o PBS. Quando carre...
27.08.2013 / 21:18
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Como salvar informações do trabalho (qstat) no SGE ao enviar para o qsub?

Ao enviar um trabalho, posso fornecer qsub com o caminho da saída padrão e o erro padrão. Por outro lado, enquanto meu trabalho 12345 está em execução, posso acessar informações adicionais relacionadas a ele usando qstat -j 12345 . Mi...
03.01.2014 / 18:19
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qsub -hold_jid -afterok loop não iniciando

Estou tentando executar uma série de tarefas enviadas ao cluster, uma após a outra, enviando o seguinte script .sh: Annotation_Loop.sh: #!/bin/bash job='qsub run_IntersectBed_1.sh 0' for i in {1..3} do job_next='qsub -hold_jid $job ru...
30.04.2013 / 20:37
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Jobs não sendo executados no Torque, a instalação do Maui não ajudou

Então, acabei de instalar o Torque em um pequeno cluster que estamos configurando e tudo parecia ter sido muito tranquilo. Eu tenho pbs_mon em execução nos nós de cálculo e pbs_server em execução no nó principal, e pbsnodes -a do nó princ...
26.09.2011 / 18:16
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libXtst.so.6: não é possível abrir o arquivo de objeto compartilhado: Nenhum arquivo ou diretório

ATUALIZAÇÃO: depois qsub muitas vezes notei que quando o nome do host é opt ### parece funcionar, mas para outros nós em que o hostname é de topologia diferente int ###, isso não acontece. Eu discuti isso com o gerenciador de cluster e é isso qu...
04.10.2011 / 07:01
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Existe uma maneira de verificar quantos trabalhos um usuário tem na fila?

Eu sei comandos, como qsub, qstat -a, qstat -an, etc. Mas como posso encontrar quantos trabalhos um único usuário tem na fila (nem todos estão executando necessariamente) a qualquer momento?     
06.05.2015 / 19:36
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Tarefas em lote do PBS - o comando qalter

Eu tenho uma computação gigante em execução em um cluster do Scientific Linux. Atualmente, tenho mais de 600 postos de trabalho estacionados na fila, esperando pelo tempo do processador, enquanto alguns estão em execução. Estou tentando usar...
05.10.2012 / 03:52
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Como saber o tempo de envio da tarefa em lote PBS dentro do script que está sendo executado?

Estou usando o qsub da PBS para executar um script em um cluster que deve gerar um arquivo de relatório com o tempo de envio da tarefa em lote. O tempo de envio do trabalho em lote é o tempo que ele se associa ao trabalho em lote do PBS. E...
21.06.2013 / 03:43
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instalando o Grid Engine “não pode alcançar o qmaster”

Eu quero instalar o Grid Engine no meu laptop. Estou usando o Ubuntu 11.10 no VirtualBox 4.1.6. (O propósito de instalar o Grid Engine não é computar nada, eu só quero um ambiente de Grid Engine funcionando para experimentar o bash scripti...
24.03.2012 / 16:27
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Configurando um cluster

Nosso cluster é um cluster Linux com Torque e Maui. Estou lendo tutoriais online e descubro que a compilação é apenas no nó principal, e depois de enviar o trabalho pelo qsub, os outros nós estão executando o executável compilado no nó principal...
31.01.2010 / 17:08